1、血常规检查
血色素、红细胞、白细胞、血小板。
在血液系统受累的系统性红斑狼疮患者中，可有溶血性贫血，失血性贫血，个别缺铁性贫血，红细胞减少，血红蛋白减少，Coombs试验阳性。白细胞总数减少，在4×109/L以淋巴细胞减少为主，可在0.5×109/L以下，很容易继发细菌、霉菌、病毒感染。在使用较大剂量糖皮质激素治疗的患者，白细胞数，中性粒细胞可中度升高。
2、尿常规检查
系统性红斑狼疮有肾脏受累时，患者可出现血尿、蛋白尿、白细胞尿和管型，肾功能不全时，尿浓缩功能下降，尿密度降低甚至固定，肌酐清除率下降。
3、血液生化检查
活动期的系统性红斑狼疮患者几乎100%有血沉增快，但血沉高低并不代表疾病的严重性，部分患者，特别是病程较长的患者，即使病情处于缓解期或长期稳定状态，血沉仍然较高。
系统性红斑狼疮患者C-反应蛋白一般不高，只是在合并感染时升高。绝大γ-球蛋白、β-微球蛋白、免疫球蛋白(lgA、lgG、lgM)均有增高，少数患者冷球蛋白增高。
活动期的系统性红斑狼疮患者补体水平下降(总补体、C3、C4下降)，免疫复合物增加，各种细胞因子如白细胞介素-1(IL-1)、IL-2、IL-6、IL-2受体，肿瘤坏死因子可增加。有肾功能不全时，有尿素氮，肌酐升高；有肝脏病变时，谷丙转氨酶、谷草转氨酶、碱性磷酸酶，γ-GT升高；伴有肌肉炎症时，还可出现肌磷酸激酶、醛缩酶、乳酸脱氢酯、谷草转氨酶升高。
长期使用糖皮质激素或肾病时，血甘油三酯，胆固醇上升，血清钾、钙和游离钙异常，白蛋白减少，血清钠、氯离子水平也可异常；也可有代谢性酸中毒或碱中毒改变。
4、自身抗体检查
系统性红斑狼疮患者存在多种自身抗体如抗核抗体(ANA)抗dsDNA抗体、抗SM抗体、抗RNP抗体、抗Ro/SSA抗体、抗La/SSB抗体、狼疮细胞、抗核糖体RNP抗体、类风湿因子、抗组蛋白抗体、抗Ku抗体、抗U抗体、抗器官特异性抗体等等。
其中抗dsDNA抗体，抗SM抗体具有诊断特异性。抗核抗体(ANA)阳性率高，可达95%，可作为参考试验，但周边型或均质型的抗核抗体多见于系统性红斑狼疮患者的血清中，具有一定的临床意义，而斑点型和核仁型多见于其他结缔组织病。狼疮细胞的检出率可达60%，多在发病初期和活动期出现，用激素或免疫抑制剂治疗后很快消失，检出狼细胞的病人并不都是系统性红斑狼疮，其他结缔组织病也可检出狼疮细胞。
临床观察，有抗dsDNA抗体和抗SM抗体阳性者常提示肾脏及神经系统等脏器出现损害者较多，病情相对较重，预后较差；若抗dsDNA抗体和抗SM抗体阴性，而抗RNP抗体阳性，则发生肾炎、神经精神病变者较少见。
抗心磷脂抗体多见于狼疮抗凝物质者，伴血小板减少，易发生习惯性流产。
抗组蛋白抗体的药物性狼疮多见。抗Ku抗体、抗U抗体阳性多数合并其他结缔组织病。器官特异性抗体包括抗红细胞抗体，抗白细胞抗体，抗血小板抗体，抗淋巴细胞抗体，抗细胞浆抗体，抗骨骼肌细胞，抗平滑肌细胞抗体，抗甲状腺上皮抗体，抗心肌抗体，抗肾小球上皮抗体，抗神经细胞抗体等，均能与各自的细胞结合，产生炎性作用。
5、心电图
有心肌病变，肺动脉高压病变，心包炎或电解质失调时，心电图有相应的异常改变。
6、放射线检查
X线可检查出系统性红斑狼疮患者的心包炎，胸膜炎，肺炎，肺部感染，肺出血，关节炎；CT扫描和核磁共振检查或神经系统、心、肺、纵膈、腹部、盆腔、脊柱关节病变均有诊断或鉴别诊断价值。
7、超声波检查
超声波对系统性红斑狼疮患者的浆膜炎、心肌炎、肝、脾、淋巴结肿大，胆囊、胰腺、肾脏泌尿道、子宫、前列腺病变均有指导意义，也可做血管炎的检查。
另外，狼疮带检查的阳性率可达40%-80%，以活动期明显，但也见于类风湿关节炎、硬皮病，混合性结缔组织病等，并非系统性红斑狼疮所特有。肾活检对系统性红斑狼疮的确诊率达100%，即使临床上没有出现肾脏异常，但肾活检也会发现异常。其他肝活检，肺活检，胃肠活检或周围神经活检，肌肉活检，滑膜活检均有助于系统性红斑狼疮的鉴别诊断。
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