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主要是染色过程当中要注意环境空气中的二氧化碳的污染以及漂洗时的漂洗液（如双蒸水）是否干净，最好是放在封闭的器具内染色，做好防止口中呼出的二氧化碳的污染。

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切片污染主要是水中杂质与铅铀反应造成的沉淀物的污染。其中，切片水槽所用的水要特别干净，否者，切片很容易黏着杂质，影响后续染色效果。同时，切片时尽量减少口中呼气与水槽水的直接接触，而这一点往往是大家所忽视的，至于染色时的防范措施，除了染色液自身的纯净外，染色板必须是干净的，每次用好以后都必须用双蒸水反复浸洗2-3次，并用干净的袋子包好存放。染色板必须放在密封效果较好的盒子内染色，盒子不宜太大太深，刚好放进染色板为好，高度要比染色板高1-2cm即可，太大太高，内部空气太多不利染色效果。