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甲醛在固定液固定时间过长甲醛会被氧化，形成甲酸，使固定液的PH值降低，酸性条件下组织会萎缩变硬，情况严重的，组织结构会遭到破坏，一般固定的时间不能超过3个月。
固定过久对免疫组化也有影响，醛基与抗原蛋白的氨基交联形成羧甲基，使抗原决定簇的三维构象出现空间障碍，分子间交联形成的网格结构可能部分或完全掩盖某些抗原决定簇，使之不能充分暴露。可造成假阴性的染色结果。